不少台湾高层智囊建议，台湾应研拟南海战略，长期规划，争取美国谅解、诉诸两岸协商，共同开发共享南海资源。两岸可以考虑把南海问题列入两岸两会协商议题，并成立“两岸南海事务协调小组”，纳入两岸两会或更高层次讨论。
两岸两会可讨论共同开发南海资源
“中央研究院”亚太区域研究专题中心南海研究社群召集人宋燕辉分析，大陆藉由这次机会，让维护岛屿领土主权作法常态化。 菲律宾希望拉拢美国，也寻求东协国家合作，只不过，美国宣称要中立，东协也想要强化与大陆合作，国外学者因而形容菲律宾像个孤儿。
宋燕辉建议，台湾应研拟完善的南海战略规划，应在硬实力与软实力之间， 以巧实力出发，例如以民意为基础，争取美方谅解，与大陆协商，共同开发南海资源。政策研究基金会内政组副召集人李英明撰文指出，两岸对南海主权和相关争端，都主张以和平或共同开发方式解决，两岸可以考虑把南海问题列入两岸协商议题，并成立“两岸南海事务协调小组”，纳入两岸两会或更高层次讨论。
海洋资源坚持两岸享南海权益优先权
南海海域面积350万平方公里，南海盆地群石油地质资源量估计约230亿吨至300亿吨，天然气总地质资源量约16兆立方公尺。据1982年通过、1994年实施的
联合国
海洋公约，每个国家（包括岛礁）享有12里领海，以及外延200里的专属经济区。
因此，政策研究基金会内政组副召集人李英明主张，两岸在南海海洋资源分配上，可合作维护南海诸岛及其12里领海范围海洋权益；对“U型线内历史性水域”更要合作坚持两岸享有南海权益优先权。
宋燕辉也认为，台湾应该要有完整且长期的南海战略规划，对于南海议题，也应该与大陆协商，共同开发渔业、油气等天然资源。
两岸学者可到太平岛举办论坛交换意见
担任过“国安会”谘询委员的翁明贤认为，两岸合作处理南海问题现在有发展的空间，台湾应扮演积极角色，主动促成两岸专家学者到东沙岛、太平岛举办论坛交换意见。
翁明贤专研评论南海问题多年，他指出，美国从2009年宣示战略重返亚太，2012年的国家战略报告也确定战略东移到亚洲，切入点就在南海，美国在找机会介入。
